您的车辆如果经4S店检查确认存在质量问题，可以依据汽车三包规定和厂家的质保承诺先进行三包修理。根据您叙述的情况来看，4S店可能尚未查出故障部位，建议先查清问题根源，然后再确认如何维修。根据汽车三包规定，车辆如果不是在购买后60日或者3000公里内出现变速器的主要零部件质量问题，那么4S和厂家可以自主根据故障情况确定是否更换变速器总成。根据行业惯例，如果需要拆解变速器进行大规模维修，可能会更换变速器总成；如果只是更换油底壳或密封圈，则通常是进行部件更换或维修。所以，仅根据您提供的信息，无法判断更换变速器总成的可能性高低，建议您再到4S店进行检查，先查清故障的具体部位和根本原因，再协商确定维修方式。另外，也建议您通过点击本网首页的“汽车投诉”或者拨打汽车投诉电话010-65537365提交一份详细的投诉。