根据你的描述，E200车型应该是9档手自一体变速器，降档冲击的现象很可能跟控制程序有关，4S店采取升级电脑程序来消除故障现象是可行的办法。如果确定是产品质量问题，升级程序也计入三包维修时间和维修次数。如果单次维修占用时间超过5日，4S店应当提供代步车或者给予消费者适当的交通补偿，奔驰维修工单中会记录一次维修的开始和关闭时间，如果超过5日您就有权向4S索取代步车或者提出交通补偿。但是，根据您的叙述，您的车辆有可能没有达到退换车条件。此时，解决质量问题最好的方式还是进行免费的三包修理。通常4S店在维修时不会轻易动其它与故障不相干的零部件的。建议您每次维修都保存好报修和检修的记录单，以便日后万一出现问题时能够更好维护自己的合法权益。建议您再与4S店和厂家进行协商，争取通过协商解决问题，如果协商不成，可以向当地消协或者质监部门投诉，请他们出面调解，您也可以通过本网“在线投诉”或者汽车质量投诉热线电话01065537365提供一份详细的投诉信息。